Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW41

Wfdc9, Protein WFDC9, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wfdc9Q3UW41 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wfdc9Q3UW41 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wfdc9Q3UW41 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Wfdc9Q3UW41 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wfdc9Q3UW41 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wfdc9Q3UW41 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wfdc9Q3UW41 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wfdc9Q3UW41 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wfdc9Q3UW41 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wfdc9Q3UW41 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wfdc9Q3UW41 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wfdc9Q3UW41 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Wfdc9Q3UW41 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wfdc9Q3UW41 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wfdc9Q3UW41 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wfdc9Q3UW41 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wfdc9Q3UW41 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wfdc9Q3UW41 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wfdc9Q3UW41 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Wfdc9Q3UW41 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Wfdc9Q3UW41 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Wfdc9Q3UW41 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wfdc9Q3UW41 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wfdc9Q3UW41 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Wfdc9Q3UW41 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wfdc9Q3UW41 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wfdc9Q3UW41 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wfdc9Q3UW41 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wfdc9Q3UW41 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wfdc9Q3UW41 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wfdc9Q3UW41 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wfdc9Q3UW41 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wfdc9Q3UW41 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wfdc9Q3UW41 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wfdc9Q3UW41 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wfdc9Q3UW41 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wfdc9Q3UW41 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wfdc9Q3UW41 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wfdc9Q3UW41 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wfdc9Q3UW41 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wfdc9Q3UW41 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Wfdc9Q3UW41 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wfdc9Q3UW41 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms