Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B230104I21RikQ3USW4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B230104I21RikQ3USW4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
B230104I21RikQ3USW4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
B230104I21RikQ3USW4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
B230104I21RikQ3USW4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
B230104I21RikQ3USW4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
B230104I21RikQ3USW4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
B230104I21RikQ3USW4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
B230104I21RikQ3USW4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B230104I21RikQ3USW4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms