Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Parp3Q3ULW8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Parp3Q3ULW8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Parp3Q3ULW8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Parp3Q3ULW8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Parp3Q3ULW8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms