Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULL6

Upf3b, UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog B (yeast), mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf3bQ3ULL6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Upf3bQ3ULL6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Upf3bQ3ULL6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms