Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp19Q3UJD6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp19Q3UJD6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp19Q3UJD6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp19Q3UJD6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp19Q3UJD6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp19Q3UJD6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp19Q3UJD6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp19Q3UJD6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp19Q3UJD6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp19Q3UJD6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp19Q3UJD6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp19Q3UJD6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp19Q3UJD6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp19Q3UJD6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp19Q3UJD6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp19Q3UJD6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp19Q3UJD6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp19Q3UJD6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp19Q3UJD6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp19Q3UJD6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp19Q3UJD6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp19Q3UJD6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp19Q3UJD6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp19Q3UJD6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp19Q3UJD6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp19Q3UJD6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp19Q3UJD6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp19Q3UJD6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp19Q3UJD6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp19Q3UJD6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp19Q3UJD6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Usp19Q3UJD6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms