Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmed8Q3UHI4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmed8Q3UHI4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmed8Q3UHI4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmed8Q3UHI4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmed8Q3UHI4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmed8Q3UHI4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms