Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pitpnm3Q3UHE1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pitpnm3Q3UHE1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms