Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Yipf3Q3UDR8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.2 ms