Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trip13Q3UA06 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms