Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1T3

Brms1l, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1lQ3U1T3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Brms1lQ3U1T3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brms1lQ3U1T3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms