Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Palb2Q3U0P1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms