Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0L2

Ankrd33b, Ankyrin repeat domain-containing protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd33bQ3U0L2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ankrd33bQ3U0L2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd33bQ3U0L2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd33bQ3U0L2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd33bQ3U0L2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd33bQ3U0L2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd33bQ3U0L2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd33bQ3U0L2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd33bQ3U0L2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd33bQ3U0L2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd33bQ3U0L2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd33bQ3U0L2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd33bQ3U0L2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd33bQ3U0L2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd33bQ3U0L2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms