Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hace1Q3U0D9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms