Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pbxip1Q3TVI8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pbxip1Q3TVI8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms