Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ccdc136Q3TVA9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ccdc136Q3TVA9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ccdc136Q3TVA9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ccdc136Q3TVA9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ccdc136Q3TVA9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ccdc136Q3TVA9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ccdc136Q3TVA9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
Ccdc136Q3TVA9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ccdc136Q3TVA9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ccdc136Q3TVA9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ccdc136Q3TVA9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ccdc136Q3TVA9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ccdc136Q3TVA9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ccdc136Q3TVA9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ccdc136Q3TVA9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ccdc136Q3TVA9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Ccdc136Q3TVA9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Ccdc136Q3TVA9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
Ccdc136Q3TVA9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ccdc136Q3TVA9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ccdc136Q3TVA9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ccdc136Q3TVA9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ccdc136Q3TVA9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ccdc136Q3TVA9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ccdc136Q3TVA9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ccdc136Q3TVA9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ccdc136Q3TVA9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ccdc136Q3TVA9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ccdc136Q3TVA9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ccdc136Q3TVA9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Ccdc136Q3TVA9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ccdc136Q3TVA9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ccdc136Q3TVA9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ccdc136Q3TVA9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ccdc136Q3TVA9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ccdc136Q3TVA9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
Ccdc136Q3TVA9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Ccdc136Q3TVA9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Ccdc136Q3TVA9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Ccdc136Q3TVA9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ccdc136Q3TVA9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ccdc136Q3TVA9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ccdc136Q3TVA9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ccdc136Q3TVA9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ccdc136Q3TVA9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ccdc136Q3TVA9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Ccdc136Q3TVA9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ccdc136Q3TVA9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ccdc136Q3TVA9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ccdc136Q3TVA9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ccdc136Q3TVA9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ccdc136Q3TVA9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Ccdc136Q3TVA9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Ccdc136Q3TVA9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Ccdc136Q3TVA9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Ccdc136Q3TVA9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Ccdc136Q3TVA9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ccdc136Q3TVA9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ccdc136Q3TVA9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ccdc136Q3TVA9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ccdc136Q3TVA9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ccdc136Q3TVA9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ccdc136Q3TVA9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ccdc136Q3TVA9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ccdc136Q3TVA9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ccdc136Q3TVA9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms