Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q3TQQ9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms