Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf3c3Q3TMP1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf3c3Q3TMP1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf3c3Q3TMP1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf3c3Q3TMP1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf3c3Q3TMP1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf3c3Q3TMP1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf3c3Q3TMP1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf3c3Q3TMP1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf3c3Q3TMP1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf3c3Q3TMP1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms