Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prr27Q3SYJ2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms