Protein–RNA interactions for Protein: Q32NY4

Cnnm3, Metal transporter CNNM3, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm3Q32NY4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnnm3Q32NY4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms