Protein–RNA interactions for Protein: Q30KP4

Gm17416, Beta-defensin (Fragment), mousemouse

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Length 66 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17416Q30KP4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm17416Q30KP4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gm17416Q30KP4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Gm17416Q30KP4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Gm17416Q30KP4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Gm17416Q30KP4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Gm17416Q30KP4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Gm17416Q30KP4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm17416Q30KP4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm17416Q30KP4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm17416Q30KP4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm17416Q30KP4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm17416Q30KP4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17416Q30KP4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17416Q30KP4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17416Q30KP4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm17416Q30KP4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17416Q30KP4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17416Q30KP4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17416Q30KP4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17416Q30KP4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17416Q30KP4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17416Q30KP4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17416Q30KP4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17416Q30KP4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17416Q30KP4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17416Q30KP4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17416Q30KP4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17416Q30KP4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17416Q30KP4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17416Q30KP4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17416Q30KP4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17416Q30KP4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17416Q30KP4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17416Q30KP4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17416Q30KP4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17416Q30KP4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17416Q30KP4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17416Q30KP4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms