Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col24a1Q30D77 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col24a1Q30D77 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col24a1Q30D77 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col24a1Q30D77 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col24a1Q30D77 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col24a1Q30D77 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col24a1Q30D77 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col24a1Q30D77 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col24a1Q30D77 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Col24a1Q30D77 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Col24a1Q30D77 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col24a1Q30D77 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col24a1Q30D77 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col24a1Q30D77 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col24a1Q30D77 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col24a1Q30D77 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col24a1Q30D77 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col24a1Q30D77 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col24a1Q30D77 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col24a1Q30D77 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Col24a1Q30D77 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col24a1Q30D77 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Col24a1Q30D77 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col24a1Q30D77 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col24a1Q30D77 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms