Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Tdrd9Q14BI7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Tdrd9Q14BI7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Tdrd9Q14BI7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Tdrd9Q14BI7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Tdrd9Q14BI7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Tdrd9Q14BI7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Tdrd9Q14BI7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Tdrd9Q14BI7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Tdrd9Q14BI7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Tdrd9Q14BI7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Tdrd9Q14BI7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Tdrd9Q14BI7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Tdrd9Q14BI7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Tdrd9Q14BI7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Tdrd9Q14BI7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Tdrd9Q14BI7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Tdrd9Q14BI7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Tdrd9Q14BI7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Tdrd9Q14BI7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Tdrd9Q14BI7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Tdrd9Q14BI7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Tdrd9Q14BI7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Tdrd9Q14BI7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Tdrd9Q14BI7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Tdrd9Q14BI7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Tdrd9Q14BI7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Tdrd9Q14BI7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Tdrd9Q14BI7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Tdrd9Q14BI7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Tdrd9Q14BI7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Tdrd9Q14BI7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Tdrd9Q14BI7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Tdrd9Q14BI7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Tdrd9Q14BI7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Tdrd9Q14BI7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Tdrd9Q14BI7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Tdrd9Q14BI7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Tdrd9Q14BI7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Tdrd9Q14BI7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Tdrd9Q14BI7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Tdrd9Q14BI7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Tdrd9Q14BI7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Tdrd9Q14BI7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Tdrd9Q14BI7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Tdrd9Q14BI7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Tdrd9Q14BI7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Tdrd9Q14BI7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Tdrd9Q14BI7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Tdrd9Q14BI7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Tdrd9Q14BI7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Tdrd9Q14BI7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Tdrd9Q14BI7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Tdrd9Q14BI7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Tdrd9Q14BI7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Tdrd9Q14BI7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Tdrd9Q14BI7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Tdrd9Q14BI7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms