Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Traf3ip1Q149C2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
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