Protein–RNA interactions for Protein: Q148W0

Atp8b1, Phospholipid-transporting ATPase IC, mousemouse

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b1Q148W0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp8b1Q148W0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp8b1Q148W0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp8b1Q148W0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp8b1Q148W0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp8b1Q148W0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp8b1Q148W0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms