Protein–RNA interactions for Protein: Q148W0

Atp8b1, Phospholipid-transporting ATPase IC, mousemouse

Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b1Q148W0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp8b1Q148W0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp8b1Q148W0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp8b1Q148W0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp8b1Q148W0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp8b1Q148W0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp8b1Q148W0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp8b1Q148W0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms