Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb8Q0VBD0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms