Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cntnap5bQ0V8T8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cntnap5bQ0V8T8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cntnap5bQ0V8T8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cntnap5bQ0V8T8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cntnap5bQ0V8T8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cntnap5bQ0V8T8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cntnap5bQ0V8T8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntnap5bQ0V8T8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntnap5bQ0V8T8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntnap5bQ0V8T8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntnap5bQ0V8T8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntnap5bQ0V8T8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntnap5bQ0V8T8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cntnap5bQ0V8T8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cntnap5bQ0V8T8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cntnap5bQ0V8T8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cntnap5bQ0V8T8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cntnap5bQ0V8T8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cntnap5bQ0V8T8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cntnap5bQ0V8T8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cntnap5bQ0V8T8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cntnap5bQ0V8T8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cntnap5bQ0V8T8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cntnap5bQ0V8T8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cntnap5bQ0V8T8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cntnap5bQ0V8T8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
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