Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rab42Q0PD08 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.1 ms