Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms