Protein–RNA interactions for Protein: Q08775

Runx2, Runt-related transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx2Q08775 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Runx2Q08775 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Runx2Q08775 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms