Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp2Q08652 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms