Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnma1Q08460 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnma1Q08460 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnma1Q08460 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnma1Q08460 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnma1Q08460 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnma1Q08460 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnma1Q08460 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnma1Q08460 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnma1Q08460 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnma1Q08460 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnma1Q08460 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnma1Q08460 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnma1Q08460 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnma1Q08460 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnma1Q08460 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnma1Q08460 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnma1Q08460 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnma1Q08460 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnma1Q08460 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnma1Q08460 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnma1Q08460 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnma1Q08460 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnma1Q08460 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnma1Q08460 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnma1Q08460 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnma1Q08460 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnma1Q08460 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnma1Q08460 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnma1Q08460 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnma1Q08460 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnma1Q08460 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnma1Q08460 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnma1Q08460 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms