Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pou6f1Q07916 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pou6f1Q07916 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pou6f1Q07916 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pou6f1Q07916 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pou6f1Q07916 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pou6f1Q07916 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pou6f1Q07916 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pou6f1Q07916 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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