Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdx4Q07424 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms