Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp2Q06649 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3bp2Q06649 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3bp2Q06649 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3bp2Q06649 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3bp2Q06649 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3bp2Q06649 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3bp2Q06649 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp2Q06649 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp2Q06649 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp2Q06649 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp2Q06649 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp2Q06649 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp2Q06649 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp2Q06649 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp2Q06649 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp2Q06649 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp2Q06649 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp2Q06649 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp2Q06649 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bp2Q06649 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bp2Q06649 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bp2Q06649 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bp2Q06649 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bp2Q06649 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bp2Q06649 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bp2Q06649 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bp2Q06649 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bp2Q06649 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bp2Q06649 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms