Protein–RNA interactions for Protein: Q05BQ1

Igsf9, Protein turtle homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf9Q05BQ1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igsf9Q05BQ1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igsf9Q05BQ1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Igsf9Q05BQ1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms