Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs3Q05895 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms