Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox10Q04888 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sox10Q04888 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox10Q04888 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox10Q04888 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox10Q04888 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox10Q04888 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox10Q04888 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sox10Q04888 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sox10Q04888 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sox10Q04888 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sox10Q04888 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sox10Q04888 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sox10Q04888 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sox10Q04888 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sox10Q04888 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms