Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms