Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Col6a2Q02788 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Col6a2Q02788 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms