Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfiaQ02780 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfiaQ02780 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfiaQ02780 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfiaQ02780 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfiaQ02780 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfiaQ02780 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfiaQ02780 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfiaQ02780 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfiaQ02780 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfiaQ02780 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfiaQ02780 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfiaQ02780 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfiaQ02780 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfiaQ02780 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfiaQ02780 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfiaQ02780 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfiaQ02780 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfiaQ02780 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfiaQ02780 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NfiaQ02780 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfiaQ02780 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfiaQ02780 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfiaQ02780 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfiaQ02780 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfiaQ02780 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfiaQ02780 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfiaQ02780 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfiaQ02780 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfiaQ02780 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NfiaQ02780 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NfiaQ02780 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NfiaQ02780 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NfiaQ02780 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NfiaQ02780 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms