Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snai1Q02085 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snai1Q02085 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Snai1Q02085 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snai1Q02085 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snai1Q02085 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snai1Q02085 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snai1Q02085 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snai1Q02085 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snai1Q02085 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snai1Q02085 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Snai1Q02085 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snai1Q02085 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snai1Q02085 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snai1Q02085 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snai1Q02085 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snai1Q02085 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snai1Q02085 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snai1Q02085 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snai1Q02085 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snai1Q02085 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Snai1Q02085 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snai1Q02085 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snai1Q02085 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snai1Q02085 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snai1Q02085 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snai1Q02085 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snai1Q02085 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snai1Q02085 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snai1Q02085 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snai1Q02085 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snai1Q02085 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snai1Q02085 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snai1Q02085 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Snai1Q02085 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snai1Q02085 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snai1Q02085 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snai1Q02085 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snai1Q02085 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snai1Q02085 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snai1Q02085 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Snai1Q02085 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snai1Q02085 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snai1Q02085 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snai1Q02085 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snai1Q02085 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snai1Q02085 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snai1Q02085 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snai1Q02085 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snai1Q02085 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Snai1Q02085 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snai1Q02085 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snai1Q02085 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snai1Q02085 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Snai1Q02085 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms