Protein–RNA interactions for Protein: Q02013

Aqp1, Aquaporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp1Q02013 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Aqp1Q02013 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Aqp1Q02013 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Aqp1Q02013 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Aqp1Q02013 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Aqp1Q02013 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Aqp1Q02013 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Aqp1Q02013 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Aqp1Q02013 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Aqp1Q02013 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Aqp1Q02013 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms