Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RykQ01887 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RykQ01887 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RykQ01887 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RykQ01887 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RykQ01887 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RykQ01887 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RykQ01887 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RykQ01887 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RykQ01887 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RykQ01887 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RykQ01887 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RykQ01887 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RykQ01887 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RykQ01887 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RykQ01887 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RykQ01887 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RykQ01887 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RykQ01887 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RykQ01887 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RykQ01887 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RykQ01887 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RykQ01887 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RykQ01887 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
RykQ01887 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RykQ01887 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RykQ01887 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RykQ01887 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RykQ01887 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RykQ01887 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RykQ01887 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RykQ01887 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RykQ01887 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RykQ01887 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RykQ01887 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
RykQ01887 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RykQ01887 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RykQ01887 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RykQ01887 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RykQ01887 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RykQ01887 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RykQ01887 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RykQ01887 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RykQ01887 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RykQ01887 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RykQ01887 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RykQ01887 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RykQ01887 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RykQ01887 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RykQ01887 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RykQ01887 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RykQ01887 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RykQ01887 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RykQ01887 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RykQ01887 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RykQ01887 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RykQ01887 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RykQ01887 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RykQ01887 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RykQ01887 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RykQ01887 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RykQ01887 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RykQ01887 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RykQ01887 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RykQ01887 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RykQ01887 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RykQ01887 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RykQ01887 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RykQ01887 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RykQ01887 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RykQ01887 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RykQ01887 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RykQ01887 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RykQ01887 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RykQ01887 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RykQ01887 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RykQ01887 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RykQ01887 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RykQ01887 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RykQ01887 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RykQ01887 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RykQ01887 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RykQ01887 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RykQ01887 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RykQ01887 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RykQ01887 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RykQ01887 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RykQ01887 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RykQ01887 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RykQ01887 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RykQ01887 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RykQ01887 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RykQ01887 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RykQ01887 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RykQ01887 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RykQ01887 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RykQ01887 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RykQ01887 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RykQ01887 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RykQ01887 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms