Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mc1rQ01727 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mc1rQ01727 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.5 ms