Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gbp1Q01514 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gbp1Q01514 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms