Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VegfaQ00731 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
VegfaQ00731 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VegfaQ00731 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VegfaQ00731 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VegfaQ00731 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VegfaQ00731 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VegfaQ00731 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VegfaQ00731 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VegfaQ00731 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VegfaQ00731 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VegfaQ00731 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VegfaQ00731 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VegfaQ00731 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VegfaQ00731 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VegfaQ00731 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms