Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gabpb1Q00420 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms