Protein–RNA interactions for Protein: P97436

Nkx3-1, Homeobox protein Nkx-3.1, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-1P97436 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx3-1P97436 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx3-1P97436 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx3-1P97436 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx3-1P97436 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx3-1P97436 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx3-1P97436 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx3-1P97436 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx3-1P97436 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx3-1P97436 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx3-1P97436 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx3-1P97436 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx3-1P97436 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx3-1P97436 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx3-1P97436 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx3-1P97436 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx3-1P97436 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx3-1P97436 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx3-1P97436 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx3-1P97436 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx3-1P97436 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx3-1P97436 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx3-1P97436 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx3-1P97436 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx3-1P97436 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx3-1P97436 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx3-1P97436 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx3-1P97436 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx3-1P97436 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx3-1P97436 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx3-1P97436 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx3-1P97436 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx3-1P97436 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx3-1P97436 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nkx3-1P97436 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkx3-1P97436 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms