Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Meis3P97368 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Meis3P97368 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Meis3P97368 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Meis3P97368 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Meis3P97368 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Meis3P97368 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Meis3P97368 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Meis3P97368 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Meis3P97368 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Meis3P97368 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Meis3P97368 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Meis3P97368 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Meis3P97368 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms