Protein–RNA interactions for Protein: P97353

Sec1, Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec1P97353 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec1P97353 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec1P97353 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec1P97353 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec1P97353 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec1P97353 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec1P97353 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec1P97353 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec1P97353 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec1P97353 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec1P97353 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec1P97353 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec1P97353 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec1P97353 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec1P97353 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec1P97353 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec1P97353 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec1P97353 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec1P97353 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec1P97353 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec1P97353 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec1P97353 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Sec1P97353 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec1P97353 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec1P97353 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec1P97353 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec1P97353 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec1P97353 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec1P97353 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec1P97353 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec1P97353 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sec1P97353 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sec1P97353 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sec1P97353 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sec1P97353 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sec1P97353 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec1P97353 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec1P97353 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec1P97353 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec1P97353 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec1P97353 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec1P97353 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec1P97353 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec1P97353 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec1P97353 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec1P97353 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec1P97353 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec1P97353 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec1P97353 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec1P97353 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec1P97353 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec1P97353 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec1P97353 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec1P97353 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec1P97353 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec1P97353 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec1P97353 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec1P97353 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms